在现代社会中，有一群被称为“驱魂师”的特殊人士，他们专门与潜伏于人类世界中的灵魂战斗。故事的主角桂木桂马是一个天才游戏玩家，他以完美的攻略能力闻名。然而，他的生活却因一次意外而发生了翻天覆地的变化。

某一天，桂木桂马遇到了一位自称是女神的少女艾露西。她告诉桂木，这个世界充满了各种各样的灵魂，有些是普通的亡灵，有些则是拥有强大意志的恶灵。这些恶灵会对人类造成威胁，因此需要驱魂师来净化它们。而桂木则被选中成为了一名驱魂师，因为他具备了超凡的游戏技巧和逻辑思维能力。

为了帮助桂木适应新的身份，艾露西赋予了他一枚特殊的徽章。这枚徽章不仅能够召唤出武器，还能让他进入一种名为“游戏空间”的虚拟现实环境。在这个空间里，桂木可以利用自己的游戏经验，通过解谜和策略战胜敌人。随着故事的发展，桂木逐渐发现，这个世界远比他想象的更加复杂。

在执行任务的过程中，桂木结识了一群志同道合的朋友，其中包括同样身为驱魂师的同伴们。他们各自有着不同的背景和技能，但都共同致力于保护人类免受灵魂侵扰。与此同时，桂木也渐渐了解到，这些灵魂背后往往隐藏着令人痛心的故事。有些灵魂之所以无法安息，是因为他们在生前留下了未完成的心愿或遗憾。

桂木开始思考，作为一名驱魂师，他的使命不仅仅是消灭恶灵，更重要的是倾听他们的诉求，并帮助他们找到内心的平静。于是，他决定用自己的方式，为那些徘徊的灵魂带来解脱。在这个过程中，桂木不仅成长为一名优秀的驱魂师，还收获了珍贵的友情和爱情。

《只有神知道的世界》不仅仅是一部关于战斗和冒险的作品，它更深层次地探讨了人性、死亡以及生命的意义。通过桂木桂马的经历，我们看到了一个充满挑战与成长的世界，在这里，每个人都有机会成为英雄，只要愿意用心去理解和关爱他人。